Глава 3

• Убери из текста все определения - например, все в комиссии ГАК знают, что такое "линия регрессии" - просто пользуйся этой терминологией, как это делают спецы и всё - по принципу "умный не спросит - дурак не поймёт" - будет гораздо солиднее труд выглядеть!
• Глава 3 тоже должна быть переименована - вместо "Оптимизация характеристик детектирования", назови "Выбор метода оптимизации характеристик детектирования" и, потом, в заголовке речь идёт об оптимизации, а ты излагаешь методы измерений - определись сперва, например, в разделе 3.1. с измерениями, потом в разделе 3.2. переходи к оптимизации. А в преамбуле сразу после названия главы, но до параграфа 3.1 скажи, как методы измерения связаны с методами оптимизации (и упомяни про 3.3 и 3.4, если они там будут) - ведь найдутся бедолаги, которые будут читать сей труд - пожалей их - каждый абзац должен вытекать из предыдущего и из него вытекать - следующий, иначе читатель войдёт в ступор!
• В конце главы 3 приведи сводную таблицу, по которой обоснуй выбранный тобой метод оптимизации.
• Рекомендации по разделу 3. Внесите логику в порядок материала! Опишите в принципе, что мы детектируем. Вот реактор с раствором. В нем один или несколько флуорофоров. Их флуоресценция независимо меняется по определенной кривой. Измерения проводятся с таким-то интервалом при таком-то времени на точку. Цель — получить кривую сигнала (уровня флуоресценции каждого красителя) с определенной точностью. Опишите, что значит точность в данном случае, как мы ее определяем, какова точность у существующих приборов в аналогичных задачах. Далее, описывайте стенд и протокол измерений. Приведите получаемые данные графиками, покажите стабильность/нестабильность, фоновый уровень, шумы, возможность улучшить результат путем усреднения по спектру и по времени. Обсудите источники шумов и возможные технические методы их снижения. Сделайте вывод по достижению целевого уровня сигнал/шум для одиночного красителя. И потом переходите к смесям. (По смесям, надо доделать обсчеты и обдумать их.)
• И уберите из раздела 3 всё, касающееся измерений с временным разрешением. Это же вообще не про нас. Это может пойти в общий обзор по физике флуоресценции и ее измерениям (пункты 1.3-1.4).